元氏暴亡，使得独孤伽罗首先怀疑到了最受杨勇宠爱的偏妃元昭训的头上，高度怀疑是云氏为窃占太子妃之位，下毒害死了元氏，逼令杨勇于元氏死去的当日将云氏赶出东宫，贬为庶民。

杨勇在元氏死因尚未查明的情况下，自然舍不得将最宠爱的云氏贬出东宫，于是在独孤伽罗面前极力替云氏求情，争辩说元氏之死与云氏无关，并以自己在元氏死后决不再立正妃向独孤伽罗保证，元氏之死纯属意外，并非别人蓄意加害所致。

但是，一向对男人私宠偏房，冷落嫡妻最为痛恨的独孤伽罗哪里听得进去儿子的解释，杨勇越是回护云氏，她就越是疑心元氏是死于云氏的暗害，母子两人为了此事，在大兴宫大闹了一场，最终独孤伽罗甚至向杨勇叫嚷出了这样的话：“我决不会任由阿云生的儿子有朝一日坐上皇位，要我们杨家世世代代向他叩头膜拜的，见地伐，你今日不废了阿云和她生的儿子，就休怪为娘狠心了。”

要是杨勇当时稍微冷静下来，能够认清自己的处境，他就决不会对独孤伽罗向他冲口说出这样的话置之不理，拍拍屁股，扬长而去，返回东宫亲自操持元氏的葬仪来了。

独孤伽罗眼见杨勇为了一个云氏，竟然连太子之位都不要了，气得在正阳宫中大病了一场，身体一经恢复便一改先前对杨勇全力支持的态度，劝杨坚急诏次子杨广返回长安，表面上说的是自己因元氏之死，对二儿媳萧厄甚为挂念，想召她回京陪自己住上段日子，可杨坚和她本人都明白，这就是行将废黜长子杨勇，改立次子杨广为太子的讯号了。

杨坚本就因杨勇私扩东宫六率一事，对这位长子起了深深的戒心，后又因次子杨广多年来为朝廷屡立功勋，不仅一举扭转了数十年来中原皇朝在与突厥的纷争中始终处于下风的颓势，使称霸关外草原的突厥汗国向大隋俯首称臣，沦为了隋朝的附庸，而且在他的主持下，查破了悬而未破多年的南陈“雁巢”一案，并做为伐陈的全军主帅，统军伐灭了南陈，实现了南北统一大业，在杨坚的心底，已开始产生了由立长向立贤转变的念头。加之此时受到皇后的劝说，也就顺水推舟，派李玉儿赶赴广陵急召杨广夫妻二人返回长安，一来借此试探试探朝中大臣对自己行将废立太子的反应，二来也想给杨勇一个警示，告戒他不要太过任性，为了一个女人，就置太子之位于不顾。倘若杨勇能以此为戒，主动找独孤伽罗承认错误，贬云氏母子出东宫，按杨坚的本意，或许还不至于下诏废了杨勇。

然而，就是这一道发往广陵的诏书，却在长安朝中引发了一场喧然大波，这却是杨坚夫妻始料未及的。

当杨广、萧厄夫妻二人尚未奉诏从广陵返回帝都长安之时，长安城中就已开始流传起了种种关于皇帝即将改立新的太子的传言，以尚书左仆射高颖为首，上百位朝中重臣联名上书杨坚，请求皇帝恢复太子杨勇参掌朝政之权，以正视听，稳定朝局。